为了保障实验室的正常运行与良好发展，实验室制定了专门的管理办法与制度。主要采取实验室主任负责制，学术委员会指导实验室的发展，固定研究人员实行聘任制。

  （1）实验室学术委员会的指导作用 

   学术委员会是实验室的学术领导机构，负责把握实验室定位和主要研究方向，对实验室学科建设、人才培养、开放交流、成果评价及运行管理等重大事项提出指导性意见。学术委员会每年召开1次全体会议和不定期召开专题学术研究会议。此外学术委员会委员不定期来实验室开展讲学、学术指导、参加研究生答辩等活动。

  （2）实验室主任负责制 

   实验室主任全面负责实验室的运行工作。根据实验室管理条例的有关条款进行实验室的管理工作，定期召开实验室主任工作会议和课题组首席专家会议研究工作，制定政策以稳定实验室的固定技术队伍及促进科研人员的流动和学科的相互渗透，努力吸收和培养青年科技人员，吸收有成就的出国留学、进修人员来本实验室工作，保持实验室科研人员队伍合理结构。实验室主任按照学术委员会确定的研究方向及审定的研究课题负责科研课题的组织管理，定期召集实验室主任工作会议落实科研计划的实施和经费的管理使用；定期向上级主管部门和学术委员会汇报工作，在任期内努力把实验室办成跻身于世界先进行列的科学研究基地和人才培养中心。实验室副主任分工负责实验室的基础建设和技术管理，保证设备和仪器的正常运行和良好维护，组织日常的学术交流和学术刊物的出版，检查各课题的年终进展和已完成课题的总结工作。

  （3）实验室人员实行聘任制 

   实验室在国内外公开招聘学科、学术带头人和课题首席专家及主要固定研究人员；流动人员和客座研究人员则根据研究工作的需要和争取到课题的实际情况进行招聘，其流动编制经实验室主任核准后，相关费用由课题组负担；根据实验室运行管理需要，聘任一定数量的技术人员和辅助管理人员。